El gas-oil, por ser más ligero que el agua (menor densidad), "flotará" sobre el agua. Es decir, el agua se depositará en el fondo del depósito de combustible, seguramente en el lugar en el que está el tubo que succiona el gas-oil para llevarlo al motor. Si tienes filtro decantador, se irá depositando el agua en su taza, es cuestión de ir haciendo pasar el combustible por el decantador y dejar que separe ambos líquidos, bien mediante la bomba manual, bien por funcionamiento directo del motor, y una vez alcanzado un nivel de seguridad en la taza del decantador, vaciar el agua. Si sospechas que la cantidad de agua que ha entrado puede ser muy grande y que podría exceder el control que hicieses sobre el decantador, lo más conveniente sería que desmontases la tapa donde va el mecanismo de la boya de nivel (aforador) y que a través de éste registro, intentaras absorver el agua de la parte más profunda del depósito. Si lo haces así, te evitas tener luego que purgar el circuito de alimentación del motor, como no sé que conocimientos tienes sobre el tema, te doy ésta como primera opción. Otra opción, es desconectar la tubería de alimentación del depósito al motor y dejar que fluya el agua, esto tiene el inconveniente de que seguramente cogerá aire la tubería al volver a conectarla y, lo dicho, tendrás que purgar el circuito.
Si no es mucho, repito, la mejor opción es la de ir controlando el decantador y vaciándolo, pero... ¿tienes decantador?


