Los diodos son unos elementos eléctricos que solo dejan pasar la corriente en un sentido. De esta forma si el alternador (que a fin de cuentas suele ser el equipo básico que carga las baterías en un barco) genera una determinada corriente, esta va al separador de diodos, entra por su polo común y sale A para la batería de arranque y B para la de servicio. Como hemos de suponer que los circuitos están debidamente separados (con solo la batería de servicio conectada, no deberías poder arrancar el barco y al revés no deberías poder conectar la rádio) los diodos evitan el reflujo de electricidad más allá de ellos, osea que aisla los circuitos..
por lo que te ocurre con la rádio parece que puedan suceder tres cosas
- el cable que llega hasta la radio está jodido y causa malos contactos
- el alternador no funciona correctamente (se enciende alguna luz en el tablerro? has probado de cargar la batería con un cargador?)
- la batería esta jodida y no acepta más carga
Finalmente, SI si una batería está estropeada puedes estropear con facilidad otra nueva que no esté debidamente aislada.
También si el alternador da poca carga puedes estropear ambas baterías al consumir electricidad mas allá de sus propios límites.
Aunque el problema mas grave podría ser tener la instañlación en mal estado, pues habría riesgo de incendio.