[pppitillo]

Polen, lo más importanate (más que la capacidda pues como dice Quim siempre se puede ampliar a base de tarjetas), es la velocidad de procesador, ya que si es lento se te pueden colgar programas tipo Maxsea, etc.
Las diferencias:
De un PC de los normales:
PROS: Hay a buenos precios (350€/400€), buena capacidad (120 megas) y velocidda procesador, pantalla más grande, WIFI, sistema operativo XP ó Vista (para mi mejor el primero), tienen wi-fi.
CONTRAS: 220v (a utilizar con transformador en el velero), mayor consumo, disco duro más sensible a los golpes/movimientos bruscos.
Los Nuevos "Mini" PC:
PROS: Un poco menos de precio (300€), los hay con discos sólidos (menos consumo y menos problemas al tema de golpes).
CONTRAS: Pantallas más pequeñas (9/10 pulgadas) aunque suficientes, no todos utilizan Windows, menos capacidad (solventable con memorias externas/pendrive), no todos con wi-fi, menor velocidad procesador.
Para mi opinión, si lo vas a utilizar para navegación costera y no intensiva, en un PC normal la relación costo-calidad es superior (así como la oferta) y además lo puedes utilizar en casa/trabajo/ocio con más prestaciones.
Si fuera para uso intensivo por el tema del consumo/golpes, la alternativa de un Mini PC con disco sólido es factible.
Otra alternativa, es los Mini PC que utilizan en los coches tuneados, que incluso van a 12v directamente, lo que es un problema menos.
Miraré para ver si encuentro una web sobre este tipo de PC Car, te la confirmo y lo miras (también en San Google puedes encontrar cosas).
Saludos.