no te preocupes, existen pasacables de calidad
ejemplo:
http://www.latiendadelnavegante.com/...p?c=0202100100
Otra posibilidad, es dejar la antena dentro, y mediante un cable alargador y una presilla afirmarlo en cubierta cada vez que desees usar el GPS. Además, tal y como te han dicho, si la antena tiene una buena sensibilidad, aun dentro del camarote tendrá una cobertura mas que fiable
