Yo tengo en los cofres juntas "a la medida" realizadas segun se describe.
1 Retiras las juntas existentes en su totalidad y limpias bien la zona a operar.
2 Pones alrededor de la parte de la tapa donde apoya en el cofre un generoso cordón de silicona de intemperie (la hay que resiste el agua de mar, mas barata que el Sika 291) blanca o translúcida, que calcules va a ser "espachurrado" ligeramente al cerrarse la tapa.
3 Antes de cerrar la tapa recubres la zona donde se apoyaría la silicona con tiras de film transparente de cocina al objeto de no pegar definitivamente el cofre, cierras la tapa con su pestillo, y la dejas 24/36 horas quieta, sin siquiera sentarte.
4 Pasado el plazo, abres y retiras el plastico suavemente(no vale luego pal bocata

). Y si te has quedado corto en algún punto, retocas de silicona, mas film y a esperar otro día.
En lugar de film puedes dar en el lado contrario al cordón, p. ej:
a) Vaselina

b) Nivea

c) Crema de belleza de la Almiranta (Kanebo va bien)

d) Grasa de caballo

e) Kilo y cuarto de Jabugo 5 jotas

... cosas grasientas para que la junta pegue sólo en un lado.
Espero haberme explicado. Si no, intentaría hacer un dibujo.
Suerte!
