Algunas bombas en el modo automatico, funcionan durante 10/20/30 segundos cada X minutos, si no hay agua se paran a los 10/20/30 segundos (depende de la bomba).
Comprueba si luego se paran solas, si no, a revisar cables.
Saludos y
EDITADO: Las bombas a las que me refiero no llevan boya de nivel