Hola Capgros:
Hemos recorrido Croacia de norte a sur y puedo echarte un cable. Para una semana (5 días reales de navegacion) yo os recomendaría hacer el alguno de los trayectos hacia el sur, partiendo de Split o Trogir hacia Dubrovnik. Esta última es una ciudad que no debéis perderos.
Yo NO os recomiendo un charter particular. Si algo os falla en el viaje, es mucho mejor contar con el respaldo de una compañía que en un momento dado pueda incluso proporcionaros un barco nuevo.
Aqui tienes una (es la que nosotros utilizamos hace dos años con muy buenos resultados) y si entras en su página web tiene muchísima información, itinerarios, etc.
http://www.kaiser-yachting.com
Espero que te sirva.