Bien, la verdad hubiera preferido que te conteste alguien mas, pues la verdad siempre se nos puede escapar algo.
Hay algunos diagramas en otros posts que podrias buscar, para tener mas de una opinion, de todas formas te digo lo que yo pienso.
Siempre se dice que para usar dos baterias en paralelo o serie las dos deben ser iguales y con el mismo tiempo de uso.
Como las tuyas no lo son, y tu idea es usarlas para diferentes propositos cada una, hay que considerar que vas a tener dos baterias no agrupadas. Por lo tanto el switch selector debes ponerlo independiente al cable de carga, y solo se usaria en caso de una emergencia.
Veamos en tu caso, salen dos cables del motor, el negativo va la bateria 1, en borne de la bateria, (si puedes, sino deberas cambir de borne) debes conectar otro cable, grueso tambien que llevas la bateria numero 2. Ahora del positivo haces lo mismo, pero, colocas el separador en el medio. Como este calbe no va a funcionar con el arranque, no tiene que ser tan grueso, por lo general los cables de carga son de 4 mm si mi memoria no falla (cosa muy habitual de un tiempo a esta parte) de todas maneras depende de la capacidad de carga del alternador, pero por mas grueso nunca te equivocas.
Ahoras si tu quieres poder usar la bateria 2 para ayudar a la 1, en caso de una emergencia, tienes que colocar un tercer cable, en el positivo, de grueso calibre, con una llave selectora en el medio, el cual siempre tendras que tener en posicion 2, si te olvidas la llave en posicion 1+2 afectaria a la bateria mas nueva, el separador en esta posicion no trabaja. La salido del switch selector, iria al panel de control para los servicios, y por supuesto que la entrada de la bateria 2 con un cable similiar al que trajiste de la bateria 1.
Una ultima cosa, si realmente piensas usar las baterias en funciones separadas no si te vale la pena el swith selector, un cable con pinza seria suficiente. En este caso te recomiendo que puedaas separar los negativos, asi cuando puenteas, primero lo haces con los positivos, luego el negativo en la segunda bateria, y por ultimo el negativo del motor seria conveniente que lo hagas en alguna parte metalica de este, (no se si es posible) Suele pasar que un chispa encima de las baterias, produzca una explosion, la verdad a mi nunca me paso, si bien cuando puedo puenteo de esta forma, las baterias modernas no es comun la fuga de gas pero conozco por lo menos un caso que si ocurrio, aunque no paso de una gran susto. La verdad que aqui no se me ocurre una solucion practica, pero decirte que solo puentes el positivo, sin las consecuencias que pueda tener,
