No me sorprendería que fueran un cúmulo de circunstancias.
- Sin duda el circuito abierto de la refrigeración es una de las primeras cosas que sufre por una larga parada en aguas biologicamente ricas (las de un puerto)
- También creo que puede tratarse de los filtros de gasoil sucios. Con el motor detenido durante mucho tiempo es facil que se obturen. Todos los motores suelen tener su própio filtro de gasoil y es muy recomendable instalar, cerca del depósito de combustible, un prefiltro que además sea decantador de agua. (habria que limpiar/sustituir los dos filtros)
- finalmente el problema eléctrico al que haces referéncia, es una tercera circunstáncia independiente, que no afecta para nada al funcionamiento del motor, puesto que un diesel no precisa para nada la electricidad una vez está en marcha.
En cualquier caso, repasa o ordena un repaso de tu motor, pues parece que lo que pueda tener se soluciona facilmente.