Aunque nuevo aquí y sin experiencia en navegación, unas consideraciones que se me ocurren por si te son útiles:
Un gps (cable o bluetooth) actual, basado en eso que dicen "chipset SIRFIII", no necesitas llevarlo en el exterior, dada su sensibilidad, así que lo mejor es llevarlo dentro de la cabina a resguardo. Ten en cuenta además que aunque sea bluetooth necesitarás conectarle una alimentación 12V (para estar tranquilo, la batería incorporada te daría una autonomía fiable, fiable de unas 3 horas).
Como programa sencillo, para el netbook, consideraría el OziExplorer (
http://www.oziexplorer.com/), puedes emplear cualquier carta "scaneada" y calibrada, incluso por tí mismo. Puedes bajarte versiones de pruebas y/o comprarlo si te convence o acudir a la mula
Pero sé consciente que, para uso en una emergencia como dices, el netbook sería muy dificil de usar en exterior en caso de mala mar, salvo que tengas una cabina de patronaje. Tendrías que pensar si te merece la pena un netbook especial, una solución de "bricolaje casero", o una PDA (o móvil tipo IPhone) con una Aquapac (
http://www.aquapac.es/) con un área de pantalla muy pequeña

y el problema de la alimentación que te comentaba para el GPS.
Yo uso (en montaña, bici y senderismo) una PDA con Ozi y un HAICOM Bluetooth desde hace 3 años y funcionan de cine, con una carta bien calibrada nada que envidiar a un GPS profesional.
Tomátelo como comentario de un compañero de barra en la taberna, insisto en que no tengo experiencia de navegación y seguro que otros cofrades sabrán más. Y tómate también otra copa por mi cuenta
