Pues no, cofrade, no hagas eso.
Si todo el sistema del barco te funciona a un voltaje nominal de 12V, el generador también debe hacerlo. Ponlos todos en paralelo y el regulador a 12V. la intensidad del mismo que sea al menos de 50A (30A es el máximo que te van a entregar los paneles). Uno bueno y robusto es el LEO2 de Atersa.
Si sospechas que tienes poca sección de cable entre los paneles y el regulador, sencillamente debes dimensionarlos, todo lo demás no me parece eléctricamente correcto, corregidme si me equivoco.
Un saludo.