Unas cervecitas, estimado alvaro y a todos lo cofrades
!!
Si entra agua en los cilindros, al ser esta incompresible, al accona el motor de arranque el cigüeñal no debería ser capaz ni siquiera de moverse.
Esto siempre que entre agua suficiente como para ocupar toda la camara de combustión. Por decirlo así, el cilindro estaría estancado y no podría subir mientras las válvulas están cerradas (en el tiempo de compresión).
En este caso debes sacar el agua de los cilindros. Un sistema que he oído (para motores de gasolina) es quitar las bujías y accionar el arranque, de forma que el agua pueda salir por los orificios de las bujía. En un diésel supongo que se puede hacer de forma similar con los inyectores, aunque creo que esto es un poco más complicado que con las bujias.
Si el motor gira, en un par de revoluciones los cilindros deberían expulsar el agua y arrancar, si no, ya es otro tema.
Mi opinion es que el colector del escape húmedo no debería ser la causa de que el motor no arranque.
Espero que te sirva de ayuda.
Un saludo!