A mi me pasaba lo mismo con mi renult de 8 cv hasta que me di cuenta que la bomba estaba montada al revés. Es decir: la montaron girada un cuarto de vuelta con lo que la toma del agua de mar la conectaron a la salida y la salida hacia el motor realmente era la entrada. El giro de la bomba y el rodete eran correctos pero como el cuerpo interior de la bomba no es simetrico el agua no circulaba.
Saqué la bomba la giré 90 grados, conecte aspiración y expulsión correctamente y se me acabo la angustia que producen estos misterios.

y espero que se arregle