Yo de protección catódica de barcos no sé nada, de proteción catódica de elementos enterrados un poquito. Lo que entiendo que debes asegurar es que la tensión que recibas en el barco no esté referenciada a tierra con objeto de que en ningún caso el casco del barco (que está a tierra) circule corriente a través de él. Para eso valdría un transformador con primario y secundario separados.
De todas formas no te fíes de lo que yo te diga, seguro que alguien te dirá algo más fiable, pero mientras unas copitas
