Lordrake,
No se si merecerá la pena que hagas la escotilla perfectamente estanca. Con el sistema que describes es difícil impedir que pase algo de agua en una inversión, pero puede optimizarse para que sea muy poca. Lo que sí debería ser es suficientemente resistente como para soportar una inversión. Si quieres hacerla totalmente estanca, habría que cambiar de tipo, pero seguramente sería muy obstrusiva y cara, o bien de acceso incómodo.
La ISO 12216 determina el grado de estanqueidad requerido en cada caso, si la memoria no me falla, pero tengo la norma en la oficina así que no podré consultarla hasta el lunes.
Mientras tanto, echale un vistazo a esto:
http://www.atomvoyages.com/projects/Companionway.htm
En cuanto a la toma de aire del motor, habría que saber que tamaño tiene para determinar si debe ser considerada punto de inundación progresiva o no, según reglamento. Se le podría colocar un sistema de cierre, incluso de accionamiento remoto, pero convendría estudiar la conveniencia de hacerlo.
¿De qué marca y modelo son los silentblocks que tiene montados tu motor?
Mándame un MP.
Saludos.