Os puedo dar dos soluciones. Entiendo que estamos hablando de un Diesel que lleva bomba de inyección.
Una es lo que usan los coches (y los barcos, of course): una pequeña electroválvula que se atornilla a la bomba y al cortar la corriente corta el paso de combustible. Naturalmente, la bomba tiene que estar prevista para ello, y a lo mejor -o mejor dicho, casi seguro- lo está si el motor para al cortar el contacto.
Si no es el caso, y es para una parada de emergencia, podéis poner un muelle que tire del estrangulador de la bomba y pare el motor en la posición libre. Luego se estira y se sujeta estirado con un alambre preparado para que se pueda fundir al meterle corriente. Al activarse el relé del MOB pone tensión en el hilo,este se funde, el muelle tira del estrangulador y el motor se para. Luego se quita el muelle y arranca de nuevo (no olvidar que lleváis el sistema si algo falla y se os para el motor de forma inesperada y no sabéis por qué

).
Os doy la idea, hay muchas maneras de implementarla, pero os sugiero que leáis un manual para hacer trampas para que el hilo que se funde sea fino y esté aislado. Haciéndolo de manera sensata es muy seguro.
Vale también para la caña.
Se podría hacer con un motor de elevalunas, el cable tiraría del estrangulador, pero considero más seguro el otro. Cuando se habla de seguridad, es mejor deshacer algo que hacer otro algo. Por ejemplo: abrir un contacto mejor que cerrarlo o romper un pasador antes que usar un motor. (Y esto último es una idea: el pasador sería el hilo a fundir).