Varios frentes abiertos:
Hombre, está claro que tienes el regulador del alternador algo perjudicado. Yo le meteria mano al alternador. Igual esto te sirve de orientación:
http://marconcio.freetzi.com/alternador.htm
En todo caso, habría que cambiar el regulador (o mandar que te lo cambiaran).
Eso por un lado. En el otro frente: la bateria daban 1,45 V

Esa es irrecuperable ¿no?
La otra bateria (la de 95 Ah) estaba totalmente desconectada? conectada al cargador de 220? No me termina de quedar claro.