Muy buenas dwelsur, primero decirte que en los foros de internet no está bien visto si escribes en MAYUSCULAS, pues esto significa que estás gritando (enfadado).
por otra parte y contestando a tus dudas te diré que si tu mujer es residente en España y esto es si esta mas de la mitad + 1 día en territorio español, creo que no podrá navegar en un barco de bandera francesa. Doy por hecho que tu mujer tiene titulación no española, pues si además si el patrón tiene titulación española debería de tener pabellón español.
De todas formas seguro que alguien mas te podrá ayudar y te lo explicará mejor que yo.
Saludos

Rafa