Mejor que uses productos específicos para la limpieza de circuitos de refrigeración como el
Nural 1 de Pattex u otros similares, no son muy caros y evitas dañar alguna parte del motor, ten en cuenta que el ácido es corrosivo y aunque limpie muy bien no te recomiendo usarlo y menos sin experiencia, si te pasas con la cantidad o con el tiempo que lo tienes en el motor puedes dañarlo. Tengo entendido que antes se hacia a veces con sosa caústica. Por otro lado revisa la bomba de agua y el termostato no vaya a estar el problema ahí.
Yo preguntaría en una tienda de recambios de automóviles sobre los productos de limpieza para el circuito de refrigeración, seguro que te salen más baratos.