Cual pensais que puede ser la causa

[folkboat]

si te sirve para descartar cosas, a mi me ha pasado alguna vez un mal contacto en el desconectador (res) de bateria. Revisa y metele un spray para contactos electricos. No sé como será el tuyo pero yo tengo uno para cada bateria y llevan una llave de plastico con el terminal de cobre, puede que ese terminal esté gastado. O en tu sistema algun mecanismo esta haciendo mal el contacto necesario.
Mecanica + electricidad para mi que no son muy buenos compañeros. Igualmente aprovecha y un poco de spray no creo que te vaya mal, y previenes lo que te estoy comentando.

suerte