Electrónica Duda conexión paneles solares

[Alduroni]

Hola compañeros, que corra las cervezas sin moderacion alguna que ya empieza el buen tiempo.
Os cuento: estoy empezando mi brico 2018 que consiste en la instalación de paneles solares solares flexibles sobre el bimini. Ya tengo comprado los paneles, el cable, conexiones y un flamante regulador Votronic MPPT de 250w duo, es decir de los que pueden cargar las baterías de servicio y la de arranque. El funcionamiento del sistema creo que lo tengo claro pero la duda es ¿en que parte de la instalación eléctrica conecto la salida de batería del regulador?.
Muchos foreros recomiendan conectar el positivo en el polo del separador correspondiente a las baterías de servicio y el negativo a tierra (es decir al negativo de la batería).
Como ya tengo pasados los cables del regulador a las baterías mi pregunta es: ¿puedo conectar el regulador a los bornes de alguna de las baterías de servicio? o como tengo un shunt de un Monitor Nasa BM1 ¿el negativo lo puedo conecta en él? ¿antes o después?

Agradecido mil veces a las amables respuestas que seguro me ahorraran horas de pruebas, saludos a todos.