por lo que dices parece que te refieres a que se queda agua por fuera y no a que te pasa dentro. Es normal que te quede agua, ya se irá o se evaporara. Si le das aceite a la teka no pasa nada, no se te va a pudrir.
Si lo que te pasa es que entra dentro por ser el tornillo pasante o un tirafondo una forma de que no te entre agua es desatornillarlo, darle un poco de sika y volver a atornillarlo. Yo he hecho eso en todos los tornillos que tengo en cubierta y he eliminado las filtraciones por completo y eso que es de molde-contramolde que parece que es más dificil encontrar la filtración... en realidad las filtarciones vienen siempre por los mismos sitios y no hay que romperse la cabeza buscando cosas raras... impermeabilizar todo tipo de fijaciones que perforen la cubierta y problema resuelto.
Si no hemos acertado intenta explicarnoslo mejor... a mi no me acaba de quedar claro a qué te refieres y cual es el problema que te causa.
