En rigor, no debería haber ningún problema. Hay barcos con pabellón extranjero no comunitario en muchos puertos, y nadie les dice nada; creo que el mismo criterio debería aplicarse a los barcos con pabellón extranjero comunitario.
Hace algún tiempo era raro ver pabellones extranjeros (recuerda que los súbditos de la DGMC podemos abanderar nuestros barcos en el extranjero sólo desde 2011), pero yo creo que esto está ya bastante normalizado.
No obstante, echa un vistazo a estos hilos, que, como digo, son algo antiguos:
https://foro.latabernadelpuerto.com/...d.php?t=150947
https://foro.latabernadelpuerto.com/...d.php?t=162121
https://foro.latabernadelpuerto.com/...d.php?t=170683
Y ante la duda, lo mejor es preguntar...
Saludos y
