Hola y
No tiene porque haber ningún problema por cortar el cable y voverlo empalmar razonablemente bien. Estamos hablando de frecuencias relativamente bajas, 40 Khz o como mucho 200 Khz. No es audio pero poco le falta.
De hecho, en los barcos que he tenido siempre les he cortado el cable y he puesto un conector, estanco, eso si, pero de unas caracteristicas relativamente normales. Si como es normal, el cable es un cable coaxial, mejor que empalmar es poner un conector "rca" o "bnc", permite montar y desmontar o si hiciera falta sacar la sonda para sustituirla, limpiarla, etc. A las sondas de ultrasonidos, no les gusta nada varias capas de antifuling, ni que las descascarillen por metodos violentos. Si se pretende optimizar su alcance y su definición deben de estar "como nuevas".
Si solo es para ver que "sonda" que hay en el puerto, pues no importa tanto

y pueden

, que no pasa nada.