La problemática de carga de un eólico es totalmente diferente a la de las placas o la corriente que viene del alternador. En primer lugar tenemos que hacer algo para evitar que el eólico quede en circuíto abierto, porque se aceleraría sin control (yo lo llevé así casi desde el principio, el Aerogén 4 venía con un regulador que se quemó en menos de un mes y no lo sustituí nunca, cuando sabía que las baterías estaban llenas, lo desconectaba dejando el circuíto abierto, y si además soplaba mucho, lo ataba; el problema es que no lo puedes dejar desatendido conectado, porque te puede freir las baterías, ni desconectado sin atar, porque se puede acelerar demasiado), entonces, o desvías la carga a una resistencia (que podría servir para calentar agua), o lo pones en corto, frenándolo..
Si una vez solucionado ese problema, si quieres tener un cargador multifase, creo que hay reguladores tipo shunt que lo hacen, pero eso no tiene mucho que ver con los reguladores MPPT solares, que lo que hacen es buscar el voltaje con el que se obtienen más watios y dejan las placas en circuíto abierto si las baterías están llenas (no hacen una carga multietapa):
