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[enric rosello]

Lo que llamas 'masilla verde de carrocero' creo que es pasta de resina pre-mezclada con fibra de vidrio (muy poco utilizada, por cierto, por los carroceros). Normalmente tiene ese color y se usa en reparaciones que requieran cierta fuerza estructural y no necesitan un acabado especialmente fino. La masilla 'blanca' de poliester o epoxy son las reinas de los acabados superficiales, pero no tienen tanta resistencia estructural como la masila de fibra.
La impermeabilidad de la masilla 'verde' es la misma que la fibra de vidrio y en reparaciones de cierta envergadura o que requieran mayores esfuerzos, siempre se agradecen unas capas de tejido laminado.
Dicho esto, sin fotos es complicado opinar en lo que concierne a tu caso.
saludos y una taza de tila!!